مواد با وجود تفاوت های زیادی که دارند در یک ویژگی مشترک اند و آن این است که به وسیله پیوندهای بین مولکولی بخشی از فضا را اشغال می کنند یا به بیان دیگر حجم دارند. این پیوندها بسته به عناصر مولکولی متفاوت می باشند. به وسیله مدل مولکولی می توان تفاوت مولکول ها و انواع پیوندها را به راحتی نشان داد. مدل های مولکولی در رنگ ها و ابعاد متفاوت ویژگی های مواد مختلف در پیوند های خود را تبیین می کنند.